이사회, 이사장, 상임감사가 독립적으로 있고 상임감사 산하에 감사실이 있습니다.
이사장 산하에 비서실, 홍보실, 안전관리팀, 사회가치추진실과 경영기획본부, 투자사업본부, 운영사업본부, 면세사업본부, 과기단지운영단 4개의 본부와 1개의 운영단이 있습니다.
경영기획본부 산하에는 기획조정실, 인사관리실, 경영지원실, 성과혁신실, 정보관리실이 있고 기획조정실 산하에 법무팀, 서울지원팀 2개의 팀이 있습니다.
투자사업본부 산하에는 미래사업처, 의료사업처, 휴양단지처, 환경사업처 4개의 부처가 있습니다.
운영사업본부 산하에는 관광사업처, 교육도시처, 박물관사업처, 공공주택처 4개의 부처가 있습니다.
면세사업본부 산하에는 면세기획처, 상품운영처, 영업처 3개의 부처가 있습니다.
과기단지운영단 산하에는 산업육성팀, 운영관리팀, 제2첨단팀 3개의 팀이 있습니다.
